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  "abstract": "Introdução: As leucemias agudas (LA) são neoplasias hematológicas agressivas, iniciadas a partir de alterações genéticas. Os rearranjos em KMT2A (KMT2A-r) são uma alteração comum em pacientes na idade precoce (menores que 2 anos) e ocorrem em torno de 80% dos lactentes com leucemia linfoblástica aguda (LLA). Como os KMT2A-r podem ocorrer com mais de 100 parceiros de fusão diferentes, um biomarcador de diagnóstico é muito útil na determinação dessas alterações genéticas. A detecção da expressão de CSPG4 (NG2) por citometria de fluxo tem sido amplamente empregada para predizer se os pacientes apresentam KMT2A-r. Porém, pesquisas prévias indicaram a ocorrência de resultados falso-negativos associados ao uso desse biomarcador. Sendo assim, um estudo nosso recente utilizou o método de aprendizado de máquina e identificou que os genes LAMP5 e SKIDA1 podem ser biomarcadores ainda mais precisos para a predição de KMT2A-r. Objetivo: Validar os biomarcadores LAMP5 e SKIDA1 como alternativas mais eficientes que o CSPG4 para a predição de KMT2A-r em LAs. Materiais e métodos: Para a validação, usamos os bancos de dados TARGET-ALL-P2, Pan-Acute Lymphoblastic Leukemia (PanALL) do St. Jude Children’s Hospital e casos de LLA-B ou -T diagnosticados entre 2018 e 2026, sendo que os casos de 2021 em diante foram tratados segundo o protocolo GBTLI-2021 e incluídos no Consórcio Genomas Câncer Brasileiro (GenLAb-INCA). Usamos os pipelines rnafusion e rnaseq do nf-core para as análises secundárias e definição do status mutacional de KMT2A e expressão gênica. O ambiente R foi utilizado para análises dos dados. Resultados: Foram incluídos 407 casos do TARGET, 735 do St.Jude e 274 do GenLAb, totalizando 1416 diagnosticados com LLA, sendo 41% do sexo feminino e 59% masculino. Destes, a proporção de pacientes com LLA-B foi 78,2% e a de LLA-T foi 21,8%. Separamos os pacientes em dois grupos: com KMT2A-r (n=34) e KMT2A-WT (n=1382) e definimos a diferença de expressão dos biomarcadores entre os grupos. Os genes SKIDA1 (p= <2e-16) e LAMP5 (p= 1,4e-11) foram significativamente superexpressos no grupo KMT2A-r em comparação com KMT2A-WT e também vimos uma diferença de expressão significativa em CSPG4 (p= 5e-8). Além disso, observamos que SKIDA1 (AUC: 0.922) e LAMP5 (AUC: 0.855) performaram melhor que CSPG4 (AUC: 0.789) e os valores preditivos (VPP, VPN) foram calculados para cada biomarcador respectivamente, SKIDA1 (0.045; 1), LAMP5 (0.045; 1) e CSPG4 (0.037; 0.99). Conclusões: Os resultados prévios mostram que LAMP5 e SKIDA1 têm desempenho superior ao CSPG4 na predição de KMT2A-r. O baixo VPP observado reflete a baixa prevalência de KMT2A-r na amostra, e não necessariamente uma limitação diagnóstica, o que é confirmado pelo elevado número de verdadeiros negativos. Esse padrão indica que os biomarcadores são mais úteis para excluir do que para confirmar o rearranjo, sendo necessária a confirmação diagnóstica por técnicas complementares. A análise por curvas ROC reforça o potencial desses genes como marcadores de triagem. Já a validação definitiva requer maior número de casos positivos para confirmar a robustez e a aplicabilidade clínica dos achados. Apoio financeiro: Programa Genomas Brasil, Ministério da Saúde, Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia (INCT) em Genômica do Câncer e Medicina de Precisão para o SUS, CNPq, FAPERJ, Swiss Bridge Foundation e The Alexander Von Humboldt Foundation. Agradecimentos: Consórcio Genomas Câncer Brasileiro, GBTLI e co-autores.",
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    "Instituto Nacional de Câncer (INCA), Rio de Janeiro, RJ, Brasil",
    "Hospital Araújo Jorge (HAJ-GO), Goiânia, GO, Brasil",
    "Hospital Manoel Novaes, Santa Casa de Misericórdia de Itabuna (HMN-BA), Itabuna, BA, Brasil",
    "Hospital Amaral Carvalho (HAC), Jaú, SP, Brasil",
    "Hospital Oncologico Infantil Octavio Lobo/ Núcleo de Pesquisas em Oncologia (NPO), Universidade Federal do Pará (UFPA), Belém, PA, Brasil",
    "Hospital São Marcos de Teresina (HSM-PI), Teresina, PI, Brasil",
    "Hospital da Criança Santo Antônio, Irmandade da Santa Casa de Misericórdia de Porto Alegre (ISCMPA), Porto Alegre, RS, Brasil",
    "Hospital Erasto Gaertner (HEG), Curitiba, PR, Brasil",
    "Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Marília (HCFAMEMA-SP), Marília, SP, Brasil",
    "Instituto de Puericultura e Pediatria Martagão Gesteira, Universidade Federal do Rio de Janeiro (IPPMG-UFRJ), Rio de Janeiro, RJ, Brasil",
    "Hospital Estadual Infantil Nossa Senhora da Glória, Vitória, ES, Brasil",
    "União Oeste Paranaense de Estudos e Combate ao Câncer (UOPECCAN), Cascavel, PR, Brasil",
    "Liga de Mossoró Estudos e Combate ao Câncer (Liga Mossoroense-RN), Mossoró, RN, Brasil",
    "Hospital São Vicente de Paulo, Universidade Federal da Fronteira Sul (HSVP-UFFS), Passo Fundo, RS, Brasil",
    "Instituto Nacional de Câncer (INCA-Pediatria), Rio de Janeiro, RJ, Brasil",
    "Santa Casa de Misericórdia de Marília (SCMM-SP), Marília, SP, Brasil",
    "Hospital Santa Izabel (HSI), Salvador, BA, Brasil",
    "Prontobaby Hospital da Criança (Grupo Prontobaby), Hospital Universitário dos Servidores (HUSE), Rio de Janeiro, RJ, Brasil",
    "Instituto Estadual de Hematologia Arthur de Siqueira Cavalcanti (HEMORIO), Rio de Janeiro, RJ, Brasil",
    "Instituto de Medicina Integral Professor Fernando Figueira (IMIP), Consórcio Genomas Câncer Brasileiro e do Grupo Brasileiro de Tratamento da Leucemia Linfoblástica Aguda na Infância (GBTLI), Recife, PE, Brasil",
    "Consórcio Genomas Câncer Brasileiro e do Grupo Brasileiro de Tratamento da Leucemia Linfoblástica Aguda na Infância (GBTLI), Instituto Nacional de Câncer (INCA), Rio de Janeiro, RJ, Brasil",
    "Consórcio Genomas Câncer Brasileiro e do Grupo Brasileiro de Tratamento da Leucemia Linfoblástica Aguda na Infância (GBTLI), Hospital Samaritano Higienópolis, São Paulo, SP, Brasil",
    "Consórcio Genomas Câncer Brasileiro e do Grupo Brasileiro de Tratamento da Leucemia Linfoblástica Aguda na Infância (GBTLI), Porto Alegre, RS, Brasil"
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