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  "abstract": "Introdução: Alterações no gene cytokine receptor-like factor 2 (CRLF2) são recorrentemente observadas em certos subtipos de leucemia linfoblástica aguda de células B precursoras (LLA-B), incluindo rearranjos, mutações e alterações no número de cópias. No entanto, em aproximadamente 50% dos casos com superexpressão de CRLF2 (CRLF2-high), o mecanismo regulatório permanece desconhecido. CRLF2 é particularmente relevante devido à ativação da via JAK/STAT, que regula a proliferação e a sobrevivência celular. Quando desregulada, contribui diretamente para características basais da carcinogênese e estão associadas a prognóstico desfavorável na LLA-B. Evidências crescentes sugerem que RNAs longos não codificantes (lncRNAs) podem desempenhar um papel central na modulação da expressão gênica. Estudos prévios do nosso grupo mostraram que os lncRNAs LINC00161, PWRN1 e RPL34-AS1 estão diferencialmente expressos (DE) em pacientes CRLF2-high. Este presente estudo tem como objetivo investigar como estes lncRNAs contribuem para a superexpressão de CRLF2 na LLA-B, explorando mecanismos regulatórios e potencial como biomarcadores e alvos terapêuticos. Metodologia: Foram incluídos 126 casos diagnosticados como LLA-B previamente caracterizados por WGS e RNA-Seq, cujos dados encontram-se disponibilizados pela iniciativa Therapeutically Applicable Research to Generate Effective Treatments (TARGET) (phs000464). Análises de correlação envolvendo LINC00161, PWRN1, RPL34-AS1, seus mRNAs alvos preditos e os níveis de expressão de CRLF2 foram realizadas utilizando os pacotes ggplot2, dplyr e ggpubr no R Studio. O impacto desses lncRNAs na expressão de CRLF2 tem sido testado por silenciamento transiente com siRNA, utilizando como modelo a linhagem celular MUTZ-5. A expressão dos lncRNAs e de CRLF2 é quantificada, após o silenciamento, por qPCR. Adicionalmente, as consequências biológicas do silenciamento dos lncRNAs serão avaliadas por ensaios de viabilidade, proliferação e apoptose. Resultados: Foi feita análise de correlação entre a expressão de cada lncRNA DE e CRLF2, o que revelou associação positiva na LLA-B, em especial, RPL34-AS1 e PWRN1, que apresentaram correlações positivas significativas com a expressão de CRLF2. Curiosamente, LINC00161 apresentou correlação positiva com CRLF2 apenas nos subtipos TCF3::PBX1 e KMT2A-r. Por outro lado, entre os pacientes B-others, apenas RPL34-AS1 mostrou correlação com CRLF2 (R=0,52; p=0,00041). Ademais, investigamos interações previamente descritas entre esses lncRNAs e mRNAs alvos relacionados ao câncer. Dentre elas, apenas a interação entre LINC00161 e MIR21 foi confirmada nos subgrupos de pacientes Ph-like, alta-hiperdiploidia e TCF3::PBX1. Em paralelo, foram realizados ensaios de silenciamento de RPL34-AS1 na linhagem MUTZ-5, utilizando a estratégia de siRNA para padronização de concentração do oligo utilizado e tempo de coleta das células pós-transfecção. A triplicata experimental apontou knockdown de RPL34-AS1 na linhagem MUTZ-5 após 72h de exposição ao siRNA anti-RPL34-AS1 a 10 nM de concentração. Conclusão: Os achados preliminares sugerem papel potencial de lncRNAs DE como mecanismo causador de CRLF2-high. Entretanto, os achados serão validados em uma série de casos com maior representatividade dos subtipos moleculares de LLA-B. Ensaios funcionais em andamento poderão elucidar os efeitos desses lncRNAs na regulação de CRLF2.",
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    "Laboratório de Genética das Leucemias Agudas, Instituto Nacional de Câncer, Rio de Janeiro, RJ, Brasil",
    "Laboratório de Regulação da Expressão Gênica, Instituto Carlos Chagas, Fundação Oswaldo Cruz, Curitiba, PR, Brasil",
    "Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Campinas, SP, Brasil",
    "Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional, Instituto Nacional de Câncer, Rio de Janeiro, RJ, Brasil"
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