ANÁLISE BIOINFORMÁTICA INTEGRATIVA DE MIRNAS NA TROMBOCITEMIA ESSENCIAL E INVESTIGAÇÃO DE SUA OCORRÊNCIA EM VESÍCULAS EXTRACELULARES HUMANAS
5 affiliations
- 1Programa de Pós-graduação em Imunologia Básica e Aplicada (PPGIBA-UFAM), Universidade Federal do Amazonas, Manaus, AM, Brasil
- 2Programa de Pós-Graduação em Fisiopatologia Médica, Faculdade de Ciências Médicas (FCM), Universidade de Campinas, Campinas, SP, Brasil
- 3Programa de Pós-graduação em Ciências Aplicadas à Hematologia (PPGH-UEA/HEMOAM), Universidade do Estado do Amazonas, Manaus, AM, Brasil
- 45Grupo Integrado de Pesquisa em Biomarcadores, Instituto René Rachou, Fiocruz-Minas, Belo Horizonte, MG, Brasil
- 5Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, Manaus, AM, Brasil
Abstract
Introdução: A trombocitemia essencial (TE) é uma neoplasia mieloproliferativa BCR::ABL1-negativa, caracterizada por proliferação clonal de megacariócitos, trombocitose e inflamação crônica. Os microRNAs (miRNAs) regulam a expressão gênica por meio da interação com mRNAs e as vesículas extracelulares (VEs) participam da comunicação intercelular, podendo transportar miRNAs. Objetivo: Identificar miRNAs diferencialmente expressos em plaquetas e células CD34+ de pacientes com TE, integrá-los à expressão de mRNAs e investigar evidências prévias de sua presença em VEs humanas. Material e métodos: Foram reanalisados os conjuntos GSE39046 (miRNAs em plaquetas), GSE103238 (miRNAs em células CD34+) e GSE103237 (mRNAs em células CD34+), comparando TE e controles. Consideraram-se diferencialmente expressos os transcritos com FDR < 0,05 e |log2FC| ≥ 0,585. Os miRNAs concordantes entre os compartimentos foram integrados a genes aumentados em TE e a alvos previstos simultaneamente pelo TargetScan e miRDB, com score miRDB > 80. Evidências experimentais foram consultadas no miRTarBase. Em 24 pacientes com amostras pareadas, foram calculadas correlações de Spearman com correção de Benjamini-Hochberg. A ocorrência dos miRNAs em VEs foi investigada no ExoCarta e Vesiclepedia. Resultados: Foram identificados 69 miRNAs diferencialmente expressos em plaquetas e 33 em células CD34+. Dez foram significativos em ambos os compartimentos e seis apresentaram a mesma direção, todos reduzidos em TE: miR-196b-5p, miR-181a-2-3p, miR-181d-5p, miR-181a-3p, miR-10a-5p e miR-181b-5p. No transcriptoma de células CD34+, 1.480 genes foram diferencialmente expressos, dos quais 516 estavam aumentados. A integração entre TargetScan, miRDB e expressão de mRNA resultou em 32 pares miRNA-mRNA envolvendo 17 genes. Vinte e quatro pares apresentaram correlação negativa e quatro alcançaram significância nominal, embora nenhum tenha permanecido significativo após correção por FDR. O par miR-181d-5p/ZFP36L1 apresentou a maior consistência integrada (ρ = -0,567; p = 0,0039; FDR = 0,124), reunindo predição consensual, registro no miRTarBase e expressão inversa. Os seis miRNAs possuíam registros prévios em VEs humanas, incluindo exossomos séricos, mas sem registros específicos em VEs de pacientes com TE ou de origem plaquetária. Discussão: A identificação dos seis miRNAs diferencialmente expressos em plaquetas e células CD34+ sugere sua participação em alterações regulatórias presentes em diferentes compartimentos da TE. Os registros prévios desses miRNAs em VEs humanas sustentam a possibilidade de atuarem como cargas vesiculares, embora não demonstrem transporte específico na doença. Não foram identificados, nas buscas realizadas, estudos sobre miRNAs em VEs de pacientes com TE, reforçando a necessidade de validação experimental. Conclusão: A integração de múltiplas camadas de dados identificou um conjunto reduzido de miRNAs e genes-alvo candidatos associados à TE. O eixo formado pelo miR-181d-5p e pelo gene ZFP36L1 destacou-se como principal candidato exploratório, embora necessite de validação experimental e confirmação em coortes independentes.
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BibTeX
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RIS
TY - JOUR
TI - ANÁLISE BIOINFORMÁTICA INTEGRATIVA DE MIRNAS NA TROMBOCITEMIA ESSENCIAL E INVESTIGAÇÃO DE SUA OCORRÊNCIA EM VESÍCULAS EXTRACELULARES HUMANAS
AU - Emanuela Vitória Barbosa ALVES
AU - Jhemerson Fernandes PAES
AU - Dania Gutiérrez TORRES
AU - Lorena Mara Silva de SOUZA
AU - Mylenna Oliveira do NASCIMENTO
AU - Andréa TEIXEIRA-CARVALHO
AU - Andréa Monteiro TARRAGÔ
PY - 2026
DA - 2026/10/23
JO - Hematology, Transfusion and Cell Therapy
DO - 10.1016/j.htct.2026.107479
UR - https://doi.org/10.1016/j.htct.2026.107479
AB - Introdução: A trombocitemia essencial (TE) é uma neoplasia mieloproliferativa BCR::ABL1-negativa, caracterizada por proliferação clonal de megacariócitos, trombocitose e inflamação crônica. Os microRNAs (miRNAs) regulam a expressão gênica por meio da interação com mRNAs e as vesículas extracelulares (VEs) participam da comunicação intercelular, podendo transportar miRNAs. Objetivo: Identificar miRNAs diferencialmente expressos em plaquetas e células CD34+ de pacientes com TE, integrá-los à expressão de mRNAs e investigar evidências prévias de sua presença em VEs humanas. Material e métodos: Foram reanalisados os conjuntos GSE39046 (miRNAs em plaquetas), GSE103238 (miRNAs em células CD34+) e GSE103237 (mRNAs em células CD34+), comparando TE e controles. Consideraram-se diferencialmente expressos os transcritos com FDR < 0,05 e |log2FC| ≥ 0,585. Os miRNAs concordantes entre os compartimentos foram integrados a genes aumentados em TE e a alvos previstos simultaneamente pelo TargetScan e miRDB, com score miRDB > 80. Evidências experimentais foram consultadas no miRTarBase. Em 24 pacientes com amostras pareadas, foram calculadas correlações de Spearman com correção de Benjamini-Hochberg. A ocorrência dos miRNAs em VEs foi investigada no ExoCarta e Vesiclepedia. Resultados: Foram identificados 69 miRNAs diferencialmente expressos em plaquetas e 33 em células CD34+. Dez foram significativos em ambos os compartimentos e seis apresentaram a mesma direção, todos reduzidos em TE: miR-196b-5p, miR-181a-2-3p, miR-181d-5p, miR-181a-3p, miR-10a-5p e miR-181b-5p. No transcriptoma de células CD34+, 1.480 genes foram diferencialmente expressos, dos quais 516 estavam aumentados. A integração entre TargetScan, miRDB e expressão de mRNA resultou em 32 pares miRNA-mRNA envolvendo 17 genes. Vinte e quatro pares apresentaram correlação negativa e quatro alcançaram significância nominal, embora nenhum tenha permanecido significativo após correção por FDR. O par miR-181d-5p/ZFP36L1 apresentou a maior consistência integrada (ρ = -0,567; p = 0,0039; FDR = 0,124), reunindo predição consensual, registro no miRTarBase e expressão inversa. Os seis miRNAs possuíam registros prévios em VEs humanas, incluindo exossomos séricos, mas sem registros específicos em VEs de pacientes com TE ou de origem plaquetária. Discussão: A identificação dos seis miRNAs diferencialmente expressos em plaquetas e células CD34+ sugere sua participação em alterações regulatórias presentes em diferentes compartimentos da TE. Os registros prévios desses miRNAs em VEs humanas sustentam a possibilidade de atuarem como cargas vesiculares, embora não demonstrem transporte específico na doença. Não foram identificados, nas buscas realizadas, estudos sobre miRNAs em VEs de pacientes com TE, reforçando a necessidade de validação experimental. Conclusão: A integração de múltiplas camadas de dados identificou um conjunto reduzido de miRNAs e genes-alvo candidatos associados à TE. O eixo formado pelo miR-181d-5p e pelo gene ZFP36L1 destacou-se como principal candidato exploratório, embora necessite de validação experimental e confirmação em coortes independentes.
SN - 2531-1379
SN - 2531-1387
ER -