AVALIAÇÃO DA INTEGRIDADE DE ÁCIDOS NUCLEICOS POR INTELIGÊNCIA ARTIFICIAL EM BIOBANCO PEDIÁTRICO
- 1Universidade de Brasília (UnB), Brasília, DF, Brasil
- 2Hospital da Criança de Brasília (HCB), Brasília DF, Brasil
Abstract
Introdução: Biobancos de hematologia pediátrica precisam preservar amostras raras e disponíveis em pequenos volumes para futuras investigações moleculares. Isso exige estratégias para conservar o DNA e o RNA remanescentes dos procedimentos diagnósticos, pois amostras primárias, como medula óssea, são limitadas na população pediátrica. Nesse contexto, avaliar a integridade dos ácidos nucleicos ao longo do armazenamento pode orientar o monitoramento das coleções e o planejamento da conservação. Objetivo: Avaliar a integridade do DNA e do RNA ao longo do tempo de armazenamento em um biorrepositório institucional, com apoio de inteligência artificial, para subsidiar o planejamento da conservação das amostras. Material e Métodos: Foram analisadas 66 amostras de DNA e 70 de RNA, armazenadas entre 2009 e 2023 no biorrepositório de um hospital pediátrico. A integridade foi avaliada por eletroforese em gel de agarose. Para a calibração contextual da inteligência artificial, dez amostras de cada analito, representando diferentes níveis de integridade, também foram analisadas no sistema TapeStation®. Os índices instrumentais obtidos foram usados como referência. As imagens dos géis foram associadas a esses índices e apresentadas como exemplos a um agente baseado no modelo multimodal GPT-5.5, acessado pelo ChatGPT. O modelo comparou os padrões de migração das demais amostras com as referências e atribuiu escores de 0 a 10. Os escores foram classificados como baixa qualidade, de 0 a 3; intermediária, de 4 a 6; e alta, de 7 a 10. A associação entre tempo e escore foi avaliada por correlação de Pearson e regressão linear. A regressão linear foi utilizada para obter uma estimativa exploratória do tempo de armazenamento correspondente ao escore médio 5, definido como limiar operacional. O projeto foi aprovado pelo comitê de ética, conforme parecer nº 7.204.817. Resultados e Discussão: Entre as amostras de DNA, 29 apresentaram alta integridade, 23 integridade intermediária e 14 baixa integridade. Entre as amostras de RNA, 17 apresentaram alta integridade, 29 integridade intermediária e 24 baixa integridade. O tempo de armazenamento apresentou correlação negativa com a integridade do DNA, com r =-0,51 e p<0,0001, e do RNA, com r =-0,80 e p<0,0001. Os modelos estimaram que o escore médio atingiria o limiar 5 após 18,8 anos para o DNA e 13,5 anos para o RNA. Esses valores descrevem a tendência média do conjunto analisado e representam estimativas do comportamento desta coleção, e não o tempo de estabilidade de uma amostra individual, prazo de validade ou parâmetro aplicável a outros biobancos. Fatores não controlados, como qualidade inicial, método de extração, estabilidade térmica e ciclos de congelamento e descongelamento, também podem ter influenciado os resultados. A combinação de eletroforese em gel de agarose, referências instrumentais e inteligência artificial pode ampliar a capacidade de triagem em centros sem equipamentos dedicados. Sua aplicação, contudo, requer validação da concordância entre os escores atribuídos pela inteligência artificial e os índices instrumentais. Conclusão: A estratégia permitiu estimar o comportamento médio da integridade do DNA e do RNA ao longo do armazenamento nesta coleção. Os resultados podem apoiar o monitoramento, a priorização de amostras e o planejamento da conservação, sem substituir métodos instrumentais quando necessários.
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BibTeX
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RIS
TY - JOUR
TI - AVALIAÇÃO DA INTEGRIDADE DE ÁCIDOS NUCLEICOS POR INTELIGÊNCIA ARTIFICIAL EM BIOBANCO PEDIÁTRICO
AU - Gabriel Borges COPELAND
AU - Brenno Vinicius Martins HENRIQUE
AU - Ricardo CAMARGO
AU - Agenor Castro Moreira SANTOS JÚNIOR
PY - 2026
DA - 2026/10/23
JO - Hematology, Transfusion and Cell Therapy
DO - 10.1016/j.htct.2026.106713
UR - https://doi.org/10.1016/j.htct.2026.106713
AB - Introdução: Biobancos de hematologia pediátrica precisam preservar amostras raras e disponíveis em pequenos volumes para futuras investigações moleculares. Isso exige estratégias para conservar o DNA e o RNA remanescentes dos procedimentos diagnósticos, pois amostras primárias, como medula óssea, são limitadas na população pediátrica. Nesse contexto, avaliar a integridade dos ácidos nucleicos ao longo do armazenamento pode orientar o monitoramento das coleções e o planejamento da conservação. Objetivo: Avaliar a integridade do DNA e do RNA ao longo do tempo de armazenamento em um biorrepositório institucional, com apoio de inteligência artificial, para subsidiar o planejamento da conservação das amostras. Material e Métodos: Foram analisadas 66 amostras de DNA e 70 de RNA, armazenadas entre 2009 e 2023 no biorrepositório de um hospital pediátrico. A integridade foi avaliada por eletroforese em gel de agarose. Para a calibração contextual da inteligência artificial, dez amostras de cada analito, representando diferentes níveis de integridade, também foram analisadas no sistema TapeStation®. Os índices instrumentais obtidos foram usados como referência. As imagens dos géis foram associadas a esses índices e apresentadas como exemplos a um agente baseado no modelo multimodal GPT-5.5, acessado pelo ChatGPT. O modelo comparou os padrões de migração das demais amostras com as referências e atribuiu escores de 0 a 10. Os escores foram classificados como baixa qualidade, de 0 a 3; intermediária, de 4 a 6; e alta, de 7 a 10. A associação entre tempo e escore foi avaliada por correlação de Pearson e regressão linear. A regressão linear foi utilizada para obter uma estimativa exploratória do tempo de armazenamento correspondente ao escore médio 5, definido como limiar operacional. O projeto foi aprovado pelo comitê de ética, conforme parecer nº 7.204.817. Resultados e Discussão: Entre as amostras de DNA, 29 apresentaram alta integridade, 23 integridade intermediária e 14 baixa integridade. Entre as amostras de RNA, 17 apresentaram alta integridade, 29 integridade intermediária e 24 baixa integridade. O tempo de armazenamento apresentou correlação negativa com a integridade do DNA, com r =-0,51 e p<0,0001, e do RNA, com r =-0,80 e p<0,0001. Os modelos estimaram que o escore médio atingiria o limiar 5 após 18,8 anos para o DNA e 13,5 anos para o RNA. Esses valores descrevem a tendência média do conjunto analisado e representam estimativas do comportamento desta coleção, e não o tempo de estabilidade de uma amostra individual, prazo de validade ou parâmetro aplicável a outros biobancos. Fatores não controlados, como qualidade inicial, método de extração, estabilidade térmica e ciclos de congelamento e descongelamento, também podem ter influenciado os resultados. A combinação de eletroforese em gel de agarose, referências instrumentais e inteligência artificial pode ampliar a capacidade de triagem em centros sem equipamentos dedicados. Sua aplicação, contudo, requer validação da concordância entre os escores atribuídos pela inteligência artificial e os índices instrumentais. Conclusão: A estratégia permitiu estimar o comportamento médio da integridade do DNA e do RNA ao longo do armazenamento nesta coleção. Os resultados podem apoiar o monitoramento, a priorização de amostras e o planejamento da conservação, sem substituir métodos instrumentais quando necessários.
SN - 2531-1379
SN - 2531-1387
ER -