IDENTIFICAÇÃO DO PERFIL MOLECULAR DE PACIENTES COM CARIÓTIPOS COMPLEXOS NA LEUCEMIA MIELÓIDE AGUDA
10 affiliations
- 1Laboratório de Genética das Leucemias Agudas, Coordenação de Pesquisa e Inovação, Instituto Nacional de Câncer (INCA), Rio de Janeiro, RJ, Brasil
- 2Hospital Manoel Novaes (HMN), Itabuna, BA, Brasil
- 3Hospital Araújo Jorge (HAJ), Goiânia, GO, Brasil
- 4Hospital São Marcos de Teresina (HSM), Teresina, PI, Brasil
- 5Hospital da Criança Santo Antônio (ISCMPA), Porto Alegre, RS, Brasil
- 6Hospital Federal da Lagoa (HFL), Rio de Janeiro, RJ, Brasil
- 7Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Marília (HC-FAMEMA), Marília, SP, Brasil
- 8Liga de Mossoró Estudos e Combate ao Câncer, Mossoró, RN, Brasil
- 9União Oeste Paranaense de Estudos e Combate ao Câncer (UOPECCAN), Paraná, PR, Brasil
- 10Grupo de Apoio ao Adolescente e à Criança com Câncer (GRAACC), São Paulo, SP, Brasil
Abstract
Introdução: A leucemia mieloide aguda com cariótipo complexo (LMA-CC) representa um subgrupo biologicamente heterogêneo e associado a prognóstico desfavorável, cuja caracterização molecular ainda permanece incompleta. Objetivo: Caracterizar os mecanismos moleculares associados à LMA-CC por meio de uma abordagem integrada genômica e transcriptômica, identificando assinaturas transcricionais específicas e alterações recorrentes no número de cópias com potencial aplicabilidade assistencial. Material e Métodos: Na etapa de descoberta, foram utilizados dados da série de casos do banco TARGET (n = 371) para análise de expressão gênica diferencial entre grupos citogenéticos. Na etapa de validação, foram incluídas, até o momento, amostras de pacientes com LMA diagnosticados entre 2021 e 2026 (n = 70), encaminhadas ao Laboratório de Genética das Leucemias Agudas (GenLAb) e caracterizadas por RNA-seq e WGS, com MLPA como análise adicional, para validação da assinatura transcricional e do perfil de CNAs identificados na descoberta. Resultados. A comparação entre cariótipo complexo e não complexo evidenciou superexpressão de ADCY5 (P = 1,2 × 10⁻⁵⁷), KCNJ4 (P = 5,3 × 10⁻⁴⁸), PAPPA (P = 5,1 × 10⁻⁴¹), GRIK3 (P = 1,3 × 10⁻³⁹) e HLF (P = 2,1 × 10⁻³⁹), e redução de TRH (P = 1,3 × 10⁻³⁴). Frente ao cariótipo normal, o padrão foi mais acentuado, com destaque para FREM1 (P = 7,2 × 10⁻⁶¹), ADCY5 (P = 9,0 × 10⁻⁵⁸) e GRIN3A (P = 2,4 × 10⁻⁴⁰). Análise focada confirmou essa assinatura como específica da LMA-CC para FREM1, PAPPA, GRIN3A, ADCY5, HLF, GRIK3 e KCNJ4 (P < 4,3 × 10⁻¹⁵ a P < 3,2 × 10⁻⁴). Por MLPA, observou-se perfil heterogêneo de CNVs, com deleções recorrentes em CDKN2A, CDKN2B, RB1 e TP53, e amplificações em MYCN e CDK6. Ainda na validação, a integração ômica permitiu reclassificar parte dos casos indefinidos, identificando subtipos como NPM1-r, NUP98-r, RUNX1::RUNX1T1 e BCR::ABL1; dados de RNA-seq de 57 pacientes já analisados revelaram fusões gênicas recorrentes em 47% dos casos (PML::RARA a mais frequente), ausência de fusões em 37,5% e fusões não recorrentes em 15,5%. Discussão. Na série de descoberta, o perfil transcricional identificado reforça que a LMA-CC possui mecanismos moleculares próprios, além dos rearranjos cromossômicos clássicos. Na validação, as CNVs por MLPA perda de supressores tumorais (CDKN2A, CDKN2B, RB1, TP53) e ganho de oncogenes (MYCN, CDK6) corroboram a instabilidade genômica do subgrupo e apontam possíveis alvos terapêuticos. As reclassificações moleculares e o perfil de fusões evidenciam impacto no refinamento diagnóstico e na estratificação de risco. Conclusão. A LMA-CC apresenta perfil molecular próprio, marcado por assinatura transcricional específica e alterações recorrentes no número de cópias, além das alterações citogenéticas clássicas. Os achados reiteram a relevância da continuidade do projeto, com foco na correlação com desfechos clínicos e no desenvolvimento de estratégias diagnósticas com aplicação assistencial.
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AB - Introdução: A leucemia mieloide aguda com cariótipo complexo (LMA-CC) representa um subgrupo biologicamente heterogêneo e associado a prognóstico desfavorável, cuja caracterização molecular ainda permanece incompleta. Objetivo: Caracterizar os mecanismos moleculares associados à LMA-CC por meio de uma abordagem integrada genômica e transcriptômica, identificando assinaturas transcricionais específicas e alterações recorrentes no número de cópias com potencial aplicabilidade assistencial. Material e Métodos: Na etapa de descoberta, foram utilizados dados da série de casos do banco TARGET (n = 371) para análise de expressão gênica diferencial entre grupos citogenéticos. Na etapa de validação, foram incluídas, até o momento, amostras de pacientes com LMA diagnosticados entre 2021 e 2026 (n = 70), encaminhadas ao Laboratório de Genética das Leucemias Agudas (GenLAb) e caracterizadas por RNA-seq e WGS, com MLPA como análise adicional, para validação da assinatura transcricional e do perfil de CNAs identificados na descoberta. Resultados. A comparação entre cariótipo complexo e não complexo evidenciou superexpressão de ADCY5 (P = 1,2 × 10⁻⁵⁷), KCNJ4 (P = 5,3 × 10⁻⁴⁸), PAPPA (P = 5,1 × 10⁻⁴¹), GRIK3 (P = 1,3 × 10⁻³⁹) e HLF (P = 2,1 × 10⁻³⁹), e redução de TRH (P = 1,3 × 10⁻³⁴). Frente ao cariótipo normal, o padrão foi mais acentuado, com destaque para FREM1 (P = 7,2 × 10⁻⁶¹), ADCY5 (P = 9,0 × 10⁻⁵⁸) e GRIN3A (P = 2,4 × 10⁻⁴⁰). Análise focada confirmou essa assinatura como específica da LMA-CC para FREM1, PAPPA, GRIN3A, ADCY5, HLF, GRIK3 e KCNJ4 (P < 4,3 × 10⁻¹⁵ a P < 3,2 × 10⁻⁴). Por MLPA, observou-se perfil heterogêneo de CNVs, com deleções recorrentes em CDKN2A, CDKN2B, RB1 e TP53, e amplificações em MYCN e CDK6. Ainda na validação, a integração ômica permitiu reclassificar parte dos casos indefinidos, identificando subtipos como NPM1-r, NUP98-r, RUNX1::RUNX1T1 e BCR::ABL1; dados de RNA-seq de 57 pacientes já analisados revelaram fusões gênicas recorrentes em 47% dos casos (PML::RARA a mais frequente), ausência de fusões em 37,5% e fusões não recorrentes em 15,5%. Discussão. Na série de descoberta, o perfil transcricional identificado reforça que a LMA-CC possui mecanismos moleculares próprios, além dos rearranjos cromossômicos clássicos. Na validação, as CNVs por MLPA perda de supressores tumorais (CDKN2A, CDKN2B, RB1, TP53) e ganho de oncogenes (MYCN, CDK6) corroboram a instabilidade genômica do subgrupo e apontam possíveis alvos terapêuticos. As reclassificações moleculares e o perfil de fusões evidenciam impacto no refinamento diagnóstico e na estratificação de risco. Conclusão. A LMA-CC apresenta perfil molecular próprio, marcado por assinatura transcricional específica e alterações recorrentes no número de cópias, além das alterações citogenéticas clássicas. Os achados reiteram a relevância da continuidade do projeto, com foco na correlação com desfechos clínicos e no desenvolvimento de estratégias diagnósticas com aplicação assistencial.
SN - 2531-1379
SN - 2531-1387
ER -