VALIDAÇÃO DOS BIOMARCADORES

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  author = {Gustavo Pires e Albuquerque SIMÕES and Caroline Barbieri BLUNCK and Thayana Da Conceição BARBOSA and Marina Chianello Nicolau FAGUNDES and Vanuza Maria ROSA and Regiana QUINTO and Larissa Bueno Polis MOREIRA and Alayde Vieira WANDERLEY and Gildene Alves COSTA and Amanda da Fontoura SAN MARTIN and Mariane Farherr CALEFFI and Robson de Castro COELHO and Bruna CARVALHO and Elaine Sobral COSTA and Gláucia Perini Zouain FIGUEIREDO and Carmem Maria Costa Mendonça FIORI and Edvis Santos Soares SERAFIM and Pablo SANTIAGO and Márcia SCHRAMM and Renata Moraes TRINCA and Juliana Teixeira COSTA and Ariadne FIGUEIREDO and Thais FERRAZ and Mecneide Mendes LINS and João Paulo De Biaso VIOLA and Luis Felipe Ribeiro PINTO and Adriana SEBER and Maria Lúcia De Martino LEE and Mariana EMERENCIANO and Bruno De Almeida LOPES},
  journal = {Hematology, Transfusion and Cell Therapy},
  year = {2026},
  month = oct,
  doi = {10.1016/j.htct.2026.107702},
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  note = {CC BY},
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TY  - JOUR
TI  - VALIDAÇÃO DOS BIOMARCADORES
AU  - Gustavo Pires e Albuquerque SIMÕES
AU  - Caroline Barbieri BLUNCK
AU  - Thayana Da Conceição BARBOSA
AU  - Marina Chianello Nicolau FAGUNDES
AU  - Vanuza Maria ROSA
AU  - Regiana QUINTO
AU  - Larissa Bueno Polis MOREIRA
AU  - Alayde Vieira WANDERLEY
AU  - Gildene Alves COSTA
AU  - Amanda da Fontoura SAN MARTIN
AU  - Mariane Farherr CALEFFI
AU  - Robson de Castro COELHO
AU  - Bruna CARVALHO
AU  - Elaine Sobral COSTA
AU  - Gláucia Perini Zouain FIGUEIREDO
AU  - Carmem Maria Costa Mendonça FIORI
AU  - Edvis Santos Soares SERAFIM
AU  - Pablo SANTIAGO
AU  - Márcia SCHRAMM
AU  - Renata Moraes TRINCA
AU  - Juliana Teixeira COSTA
AU  - Ariadne FIGUEIREDO
AU  - Thais FERRAZ
AU  - Mecneide Mendes LINS
AU  - João Paulo De Biaso VIOLA
AU  - Luis Felipe Ribeiro PINTO
AU  - Adriana SEBER
AU  - Maria Lúcia De Martino LEE
AU  - Mariana EMERENCIANO
AU  - Bruno De Almeida LOPES
PY  - 2026
DA  - 2026/10/23
JO  - Hematology, Transfusion and Cell Therapy
DO  - 10.1016/j.htct.2026.107702
UR  - https://doi.org/10.1016/j.htct.2026.107702
AB  - Introdução: As leucemias agudas (LA) são neoplasias hematológicas agressivas, iniciadas a partir de alterações genéticas. Os rearranjos em KMT2A (KMT2A-r) são uma alteração comum em pacientes na idade precoce (menores que 2 anos) e ocorrem em torno de 80% dos lactentes com leucemia linfoblástica aguda (LLA). Como os KMT2A-r podem ocorrer com mais de 100 parceiros de fusão diferentes, um biomarcador de diagnóstico é muito útil na determinação dessas alterações genéticas. A detecção da expressão de CSPG4 (NG2) por citometria de fluxo tem sido amplamente empregada para predizer se os pacientes apresentam KMT2A-r. Porém, pesquisas prévias indicaram a ocorrência de resultados falso-negativos associados ao uso desse biomarcador. Sendo assim, um estudo nosso recente utilizou o método de aprendizado de máquina e identificou que os genes LAMP5 e SKIDA1 podem ser biomarcadores ainda mais precisos para a predição de KMT2A-r. Objetivo: Validar os biomarcadores LAMP5 e SKIDA1 como alternativas mais eficientes que o CSPG4 para a predição de KMT2A-r em LAs. Materiais e métodos: Para a validação, usamos os bancos de dados TARGET-ALL-P2, Pan-Acute Lymphoblastic Leukemia (PanALL) do St. Jude Children’s Hospital e casos de LLA-B ou -T diagnosticados entre 2018 e 2026, sendo que os casos de 2021 em diante foram tratados segundo o protocolo GBTLI-2021 e incluídos no Consórcio Genomas Câncer Brasileiro (GenLAb-INCA). Usamos os pipelines rnafusion e rnaseq do nf-core para as análises secundárias e definição do status mutacional de KMT2A e expressão gênica. O ambiente R foi utilizado para análises dos dados. Resultados: Foram incluídos 407 casos do TARGET, 735 do St.Jude e 274 do GenLAb, totalizando 1416 diagnosticados com LLA, sendo 41% do sexo feminino e 59% masculino. Destes, a proporção de pacientes com LLA-B foi 78,2% e a de LLA-T foi 21,8%. Separamos os pacientes em dois grupos: com KMT2A-r (n=34) e KMT2A-WT (n=1382) e definimos a diferença de expressão dos biomarcadores entre os grupos. Os genes SKIDA1 (p= <2e-16) e LAMP5 (p= 1,4e-11) foram significativamente superexpressos no grupo KMT2A-r em comparação com KMT2A-WT e também vimos uma diferença de expressão significativa em CSPG4 (p= 5e-8). Além disso, observamos que SKIDA1 (AUC: 0.922) e LAMP5 (AUC: 0.855) performaram melhor que CSPG4 (AUC: 0.789) e os valores preditivos (VPP, VPN) foram calculados para cada biomarcador respectivamente, SKIDA1 (0.045; 1), LAMP5 (0.045; 1) e CSPG4 (0.037; 0.99). Conclusões: Os resultados prévios mostram que LAMP5 e SKIDA1 têm desempenho superior ao CSPG4 na predição de KMT2A-r. O baixo VPP observado reflete a baixa prevalência de KMT2A-r na amostra, e não necessariamente uma limitação diagnóstica, o que é confirmado pelo elevado número de verdadeiros negativos. Esse padrão indica que os biomarcadores são mais úteis para excluir do que para confirmar o rearranjo, sendo necessária a confirmação diagnóstica por técnicas complementares. A análise por curvas ROC reforça o potencial desses genes como marcadores de triagem. Já a validação definitiva requer maior número de casos positivos para confirmar a robustez e a aplicabilidade clínica dos achados. Apoio financeiro: Programa Genomas Brasil, Ministério da Saúde, Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia (INCT) em Genômica do Câncer e Medicina de Precisão para o SUS, CNPq, FAPERJ, Swiss Bridge Foundation e The Alexander Von Humboldt Foundation. Agradecimentos: Consórcio Genomas Câncer Brasileiro, GBTLI e co-autores.
SN  - 2531-1379
SN  - 2531-1387
ER  -