ANÁLISE TRANSCRIPTÔMICA EVIDENCIA REDUÇÃO DA EXPRESSÃO DE TET2 RESTRITA AO TECIDO E DE TP53 NO TECIDO E NO SANGUE NO LINFOMA DIFUSO DE GRANDES CÉLULAS B
- 1Universidade do Estado do Amazonas, UEA, Manaus, AM, Brasil
Abstract
Introdução: O linfoma difuso de grandes células B (LDGCB) é uma neoplasia agressiva e heterogênea, associada a alterações na diferenciação celular, na estabilidade genômica e resposta ao dano no DNA. TET2 codifica uma dioxigenase envolvida na desmetilação do DNA e na diferenciação das células B. TP53 codifica a proteína p53, que pode induzir parada do ciclo celular, reparo do DNA, senescência ou apoptose. No LDGCB, a desregulação desses genes pode comprometer o controle epigenético e a supressão tumoral. A comparação de sua expressão no tecido e no sangue pode revelar alterações locais e sistêmicas. Objetivo: Comparar a expressão de TET2 e TP53 no tecido tumoral e no sangue periférico de pacientes com LDGCB, utilizando dados transcriptômicos públicos, e discutir suas possíveis implicações funcionais. Material e métodos: Foram analisados transcriptomas públicos descritos nas séries GSE12195, GSE31312 e GSE83632 no GEO2R/limma, com correção de Benjamini–Hochberg e FDR<0,05. Foram comparadas 73 biópsias de LDGCB a 10 amostras de células B maduras normais purificadas; 237 casos de subtipo semelhantes a células B do centro germinativo (GCB) com 214 do subtipo semelhante a células B ativadas (ABC); e sangue de 76 pacientes com 87 controles saudáveis. Resultados: TET2 apresentou redução significativa no tecido de LDGCB nas duas sondas avaliadas (logFC=−0,882 e −0,260; p<0,0001; FDR<0,0001), enquanto no sangue periférico não houve diferença de expressão (logFC=0,049; p=0,396; FDR=0,453). Na comparação entre os subtipos moleculares, TET2 mostrou expressão discretamente maior no ABC em relação ao GCB, com concordância entre as três sondas (FDR entre 0,0000032 e 0,0036). TP53 também apresentou redução tecidual significativa e concordante nas duas sondas (logFC=−0,341; p<0,0001; FDR<0,0001 e logFC=−0,225; p=0,0016; FDR=0,0033). No sangue, TP53 permaneceu reduzido (logFC=−0,562; p<0,0001; FDR<0,0001), mas não apresentou diferença significativa entre os subtipos ABC e GCB. Discussão: A redução tecidual concordante de TET2 sugere menor capacidade transcriptômica relacionada à oxidação de citosinas metiladas e à manutenção da diferenciação das células B. Sua discreta elevação no subtipo ABC indica associação com a heterogeneidade molecular do LDGCB, enquanto a ausência de alteração sanguínea limita seu potencial como marcador circulante. A redução de TP53 no tecido é compatível com atenuação de mecanismos relacionados ao controle do ciclo celular, ao reparo do DNA e à apoptose. A alteração concordante no sangue pode refletir repercussões sistêmicas da doença ou diferenças na composição leucocitária, não necessariamente expressão pelas células tumorais. Conclusão: TET2 e TP53 apresentaram redução transcriptômica no tecido de LDGCB em relação às células B maduras normais. TET2 mostrou comportamento predominantemente tumoral, com discreta elevação no subtipo ABC e ausência de alteração no sangue. TP53 apresentou redução no tecido e na circulação, constituindo a alteração mais estável entre os compartimentos. Esses achados sugerem papéis distintos: TET2 relaciona-se principalmente ao contexto de diferenciação e heterogeneidade tumoral, enquanto TP53 conecta alterações tumorais e sistêmicas. Estudos com amostras pareadas, avaliação mutacional e validação proteica são necessários para determinar o significado funcional e clínico desses perfis. Apoio financeiro: FAPEAM, CNPq, CAPES e PROVISIT UEA.
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AB - Introdução: O linfoma difuso de grandes células B (LDGCB) é uma neoplasia agressiva e heterogênea, associada a alterações na diferenciação celular, na estabilidade genômica e resposta ao dano no DNA. TET2 codifica uma dioxigenase envolvida na desmetilação do DNA e na diferenciação das células B. TP53 codifica a proteína p53, que pode induzir parada do ciclo celular, reparo do DNA, senescência ou apoptose. No LDGCB, a desregulação desses genes pode comprometer o controle epigenético e a supressão tumoral. A comparação de sua expressão no tecido e no sangue pode revelar alterações locais e sistêmicas. Objetivo: Comparar a expressão de TET2 e TP53 no tecido tumoral e no sangue periférico de pacientes com LDGCB, utilizando dados transcriptômicos públicos, e discutir suas possíveis implicações funcionais. Material e métodos: Foram analisados transcriptomas públicos descritos nas séries GSE12195, GSE31312 e GSE83632 no GEO2R/limma, com correção de Benjamini–Hochberg e FDR<0,05. Foram comparadas 73 biópsias de LDGCB a 10 amostras de células B maduras normais purificadas; 237 casos de subtipo semelhantes a células B do centro germinativo (GCB) com 214 do subtipo semelhante a células B ativadas (ABC); e sangue de 76 pacientes com 87 controles saudáveis. Resultados: TET2 apresentou redução significativa no tecido de LDGCB nas duas sondas avaliadas (logFC=−0,882 e −0,260; p<0,0001; FDR<0,0001), enquanto no sangue periférico não houve diferença de expressão (logFC=0,049; p=0,396; FDR=0,453). Na comparação entre os subtipos moleculares, TET2 mostrou expressão discretamente maior no ABC em relação ao GCB, com concordância entre as três sondas (FDR entre 0,0000032 e 0,0036). TP53 também apresentou redução tecidual significativa e concordante nas duas sondas (logFC=−0,341; p<0,0001; FDR<0,0001 e logFC=−0,225; p=0,0016; FDR=0,0033). No sangue, TP53 permaneceu reduzido (logFC=−0,562; p<0,0001; FDR<0,0001), mas não apresentou diferença significativa entre os subtipos ABC e GCB. Discussão: A redução tecidual concordante de TET2 sugere menor capacidade transcriptômica relacionada à oxidação de citosinas metiladas e à manutenção da diferenciação das células B. Sua discreta elevação no subtipo ABC indica associação com a heterogeneidade molecular do LDGCB, enquanto a ausência de alteração sanguínea limita seu potencial como marcador circulante. A redução de TP53 no tecido é compatível com atenuação de mecanismos relacionados ao controle do ciclo celular, ao reparo do DNA e à apoptose. A alteração concordante no sangue pode refletir repercussões sistêmicas da doença ou diferenças na composição leucocitária, não necessariamente expressão pelas células tumorais. Conclusão: TET2 e TP53 apresentaram redução transcriptômica no tecido de LDGCB em relação às células B maduras normais. TET2 mostrou comportamento predominantemente tumoral, com discreta elevação no subtipo ABC e ausência de alteração no sangue. TP53 apresentou redução no tecido e na circulação, constituindo a alteração mais estável entre os compartimentos. Esses achados sugerem papéis distintos: TET2 relaciona-se principalmente ao contexto de diferenciação e heterogeneidade tumoral, enquanto TP53 conecta alterações tumorais e sistêmicas. Estudos com amostras pareadas, avaliação mutacional e validação proteica são necessários para determinar o significado funcional e clínico desses perfis. Apoio financeiro: FAPEAM, CNPq, CAPES e PROVISIT UEA.
SN - 2531-1379
SN - 2531-1387
ER -