CARACTERIZAÇÃO DO PERFIL TRANSCRICIONAL DE AID/APOBECS NA LEUCEMIA LINFOBLÁSTICA AGUDA DE CÉLULAS T
8 affiliations
- 1Programa de Carcinogênese Molecular, Instituto Nacional de Câncer (INCA), Rio de Janeiro, RJ, Brasil
- 2Hospital Araújo Jorge, Associação de Combate ao Câncer de Goiás (HAJ-GO), Goiânia, GO, Brasil
- 3Hospital Manoel Novaes (HMN-BA), Salvador, BA, Brasil
- 4Hospital Amaral Carvalho, Fundação Dr. Amaral Carvalho (HAC), Jaú, SP, Brasil
- 5Programa de Imunologia e Biologia Tumoral, Instituto Nacional de Câncer (INCA), Rio de Janeiro, RJ, Brasil
- 6Grupo de Apoio ao Adolescente e à Criança com Câncer (GRAACC)/Hospital Samaritano Higienópolis, São Paulo, SP, Brasil
- 7Hospital Beneficência Portuguesa de São Paulo (HBP-SP), São Paulo, SP, Brasil
- 8Unidade de Oncologia Pediátrica, Instituto de Medicina Integral Professor Fernando Figueira (IMIP), Recife, PE, Brasil
Abstract
Introdução: A leucemia linfoblástica aguda de células T (LLA-T) é uma neoplasia maligna agressiva que apresenta um complexo conjunto de alterações moleculares e desregulação em processos epigenéticos. No entanto, a caracterização das alterações epigenéticas permanece uma área ainda a ser explorada na LLA-T. Nesse cenário, enzimas da família AID/APOBEC (Activation-Induced Cytidine Deaminase/Apolipoprotein B mRNA Editing Catalytic Polypeptide-like), conhecidas por sua capacidade de desaminar citidinas em contexto TpC e por seu papel no desenvolvimento e progressão em diversos tipos de tumores, ainda é pouco explorada quanto ao seu impacto biológico em neoplasias hematológicas. Ainda assim, existem evidências de que assinaturas mutacionais similares às geradas pela atividade de APOBECs possuem importante papel na leucemogênese de LLA-T através da indução da expressão do oncogene LMO1. Objetivos: Elucidar o perfil de expressão de AID/APOBECs em pacientes pediátricos com LLA-T, visando compreender sua associação com a expressão de oncogenes cruciais para a leucemogênese nesta neoplasia. Material e Métodos: Foram avaliados casos diagnosticados com LLA-T entre 2021 e 2026 tratados pelo protocolo GBTLI-2021 e incluídos no Consórcio Genomas Câncer Brasileiro. Sequenciamento de RNA foi utilizado para quantificar a expressão transcricional dos genes-alvos. Análises estatísticas e gráficos foram realizadas através do software RStudio versão 2024.04.2. Resultados: Foram incluídos até o momento 31 casos de pacientes diagnosticados com LLA-T. A maioria é do sexo masculino (77,42%), com idade entre 2 e 10 anos (64,52%) e sem a presença de doença extramedular ao diagnóstico (41,94%). Avaliamos o nível de expressão transcricional dos genes da família AID/APOBECs, e obtemos que os genes com maiores medianas de expressão foram APOBEC3C (20 TPM) e APOBEC3G (11,3 TPM), p < 0,001. Verificamos uma correlação de Spearman não significativa entre os níveis de expressão de APOBEC3C e a expressão dos oncogenes frequentemente associados à leucemogênese da LLA-T (TAL1 (p = 0,0569), LYL1 (p = 0,2748), TAL2 (p = 0,4374), TLX1 (p = 0,4841), LMO2 (p = 0,6289), HOXA10 (p = 0,7302), TLX3 (p = 0,8255) e LMO1 (p = 0,8713)). Discussão: Na série de casos avaliada, revelou-se que APOBEC3C foi o gene com maior expressão transcricional quando comparada aos demais genes da família AID/APOBECs. Isto indica um possível aumento da sua atividade neste modelo. Embora não observamos correlação significativa entre a expressão de APOBEC3C e de oncogenes, TAL1 apresentou a maior correlação positiva e o menor p-valor (p = 0,0569). TAL1 está frequentemente alterado na LLA-T e é um regulador da hematopoiese normal. Conclusão: A expressão transcricional das AID/APOBECs apresentam padrões distintos, destacando-se a APOBEC3C com a maior mediana. Não observamos correlação significativa entre a expressão de APOBEC3C com a expressão de oncogenes relevantes para a LLA-T. Temos como perspectivas expandir o número de pacientes e as análises para a avaliação da associação da expressão dessas enzimas com aspectos clínico-demográficos, além de avaliar a ocorrência de assinaturas mutacionais típicas de sua atividade nesta série de casos.
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AB - Introdução: A leucemia linfoblástica aguda de células T (LLA-T) é uma neoplasia maligna agressiva que apresenta um complexo conjunto de alterações moleculares e desregulação em processos epigenéticos. No entanto, a caracterização das alterações epigenéticas permanece uma área ainda a ser explorada na LLA-T. Nesse cenário, enzimas da família AID/APOBEC (Activation-Induced Cytidine Deaminase/Apolipoprotein B mRNA Editing Catalytic Polypeptide-like), conhecidas por sua capacidade de desaminar citidinas em contexto TpC e por seu papel no desenvolvimento e progressão em diversos tipos de tumores, ainda é pouco explorada quanto ao seu impacto biológico em neoplasias hematológicas. Ainda assim, existem evidências de que assinaturas mutacionais similares às geradas pela atividade de APOBECs possuem importante papel na leucemogênese de LLA-T através da indução da expressão do oncogene LMO1. Objetivos: Elucidar o perfil de expressão de AID/APOBECs em pacientes pediátricos com LLA-T, visando compreender sua associação com a expressão de oncogenes cruciais para a leucemogênese nesta neoplasia. Material e Métodos: Foram avaliados casos diagnosticados com LLA-T entre 2021 e 2026 tratados pelo protocolo GBTLI-2021 e incluídos no Consórcio Genomas Câncer Brasileiro. Sequenciamento de RNA foi utilizado para quantificar a expressão transcricional dos genes-alvos. Análises estatísticas e gráficos foram realizadas através do software RStudio versão 2024.04.2. Resultados: Foram incluídos até o momento 31 casos de pacientes diagnosticados com LLA-T. A maioria é do sexo masculino (77,42%), com idade entre 2 e 10 anos (64,52%) e sem a presença de doença extramedular ao diagnóstico (41,94%). Avaliamos o nível de expressão transcricional dos genes da família AID/APOBECs, e obtemos que os genes com maiores medianas de expressão foram APOBEC3C (20 TPM) e APOBEC3G (11,3 TPM), p < 0,001. Verificamos uma correlação de Spearman não significativa entre os níveis de expressão de APOBEC3C e a expressão dos oncogenes frequentemente associados à leucemogênese da LLA-T (TAL1 (p = 0,0569), LYL1 (p = 0,2748), TAL2 (p = 0,4374), TLX1 (p = 0,4841), LMO2 (p = 0,6289), HOXA10 (p = 0,7302), TLX3 (p = 0,8255) e LMO1 (p = 0,8713)). Discussão: Na série de casos avaliada, revelou-se que APOBEC3C foi o gene com maior expressão transcricional quando comparada aos demais genes da família AID/APOBECs. Isto indica um possível aumento da sua atividade neste modelo. Embora não observamos correlação significativa entre a expressão de APOBEC3C e de oncogenes, TAL1 apresentou a maior correlação positiva e o menor p-valor (p = 0,0569). TAL1 está frequentemente alterado na LLA-T e é um regulador da hematopoiese normal. Conclusão: A expressão transcricional das AID/APOBECs apresentam padrões distintos, destacando-se a APOBEC3C com a maior mediana. Não observamos correlação significativa entre a expressão de APOBEC3C com a expressão de oncogenes relevantes para a LLA-T. Temos como perspectivas expandir o número de pacientes e as análises para a avaliação da associação da expressão dessas enzimas com aspectos clínico-demográficos, além de avaliar a ocorrência de assinaturas mutacionais típicas de sua atividade nesta série de casos.
SN - 2531-1379
SN - 2531-1387
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