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Peer-reviewedCC BYHematology, Transfusion and Cell Therapy

AVALIAÇÃO DO PERFIL MUTACIONAL DO GENE DDX41 NA ROTINA DIAGNÓSTICA DE LABORATÓRIO DE ANÁLISES GENÔMICAS

1 more authors
  1. 1Genesis, São Paulo, SP, Brasil
  2. 2Fleury, São Paulo, SP, Brasil
  3. 3Hermes Pardini, São Paulo, SP, Brasil

Abstract

Introdução: DDX41 é um dos principais genes mutados associados a neoplasias mieloides com predisposição germinativa e apresenta um padrão de comutação das variantes (somática/germinativa) em mais da metade dos indivíduos. Essas mutações podem ocorrer nas neoplasias mielodisplásicas (SMD), leucemias mieloides agudas (LMA) e menos frequentemente nas neoplasias mieloproliferativas (NMP). Objetivo: Caracterizar o perfil mutacional do gene DDX41 em indivíduos com neoplasias mieloides por meio de um painel somático de sequenciamento de nova geração (SNG), avaliando também potenciais variantes de origem germinativa. Material e métodos: Foram avaliadas 77 amostras de sangue periférico (SP) ou medula óssea (MO) de 68 indivíduos com mutação em DDX41 entre janeiro de 2024 e junho de 2026 em um laboratório de análises genômicas por meio de painel somático SNG customizado de 69 genes. Resultados: Do total de amostras avaliadas, a maior prevalência foi do sexo feminino (43/55,8%) e a mediana de idade de 69 anos (1-90 anos) com a seguinte distribuição por diagnóstico: SMD (32/41,6%); LMA (26/33,7%); NMP (6/7,8%); SMD/LMA (5/6,5%), SMD/NMP (4/5,2%); outros (4/5,2%). Foram identificadas 108 variantes em DDX41: missense (71/65,7%), nonsense (23/21,3%), frameshift (5/4,6%), start codon (2/1,9%), splice-site (1/0,9%) e outras (6/5,6%). A mediana da frequência alélica das variantes (VAF) foi 45,3% (2,0 - 52,8%). As variantes mais frequentes foram R525H (18/23,4%) e E122* (7/9,1%) sendo a R525H observada como um segundo hit em quase todas as amostras em que esteve presente (17/94,4%). Um padrão bi-alélico foi observado em 30 amostras (39%) e em 28 delas (93,3%), uma das variantes possuía VAF >20%, sugerindo a possibilidade de ser uma variante germinativa. Amostras com variantes oncogênicas/provavelmente oncogênicas totalizaram a metade (38/49,3%) e das que apresentaram apenas VUS (39/50,7%), 27 delas (69,2%) foram encontradas em coocorrência com outras variantes que justificavam os achados clínicos dos indivíduos. A comutação de DDX41 (bi-alélica ou com outros genes) foi observada em 43 amostras (55,8%), as quais apresentaram variantes oncogênicas/provavelmente oncogênicas principalmente em SRSF2 (14/32,6%), ASXL1 (13/30,2%), TET2 (8/18,6%), TP53 (7/16,3%) e DNMT3A (7/16,3%). Discussão: Esses dados revelaram-se consistentes com os já reportados por outros grupos, quanto ao perfil bi-alélico em DDX41, predominância de mutações de perda de função com VAF sugestiva de variante germinativa e da variante R525H como segundo hit. No entanto, a maior incidência da variante E122*, não observada na literatura científica, possivelmente pode estar associada à etnia brasileira. Variações étnicas na distribuição de mutações germinativas em DDX41 já foram relatadas em múltiplos estudos. Em coortes europeias, são mais prevalentes as variantes M1? e D140fs, enquanto A500fs e Y259C são mais frequentes na população asiática. No entanto, nota-se uma escassez de dados do perfil mutacional da população brasileira nos estudos internacionais. Conclusão: A identificação de variantes em DDX41 nas neoplasias mieloides, deve ser analisada com cautela, pois há a possibilidade de ser uma variante germinativa sendo relevante a investigação familiar e o monitoramento para detecção de variantes somáticas secundárias. Além disso, o uso de testes genômicos na população brasileira pode auxiliar na estratégia terapêutica e aumentar a representatividade nos bancos de variantes internacionais.

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SN  - 2531-1379
SN  - 2531-1387
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